ROKIT Genomics

Parse Evercode & Illumina PIP-seq 신규 런칭, 더욱 다양해진 Single-cell 플랫폼

5가지 Single-cell 플랫폼의 주요 특징과 연구 목적에 맞는 분석 옵션을 소개

Parse Evercode와 Illumina PIP-seq 신규 플랫폼을 이용한 Single-cell RNA-seq 서비스를 새롭게 런칭합니다.

단일세포 분석은 연구 목적과 샘플 특성, 분석 규모에 따라 적합한 싱글셀 플랫폼 선정이 중요합니다.

로킷제노믹스는 기존 10x Genomics, BD Rhapsody, MobiDrop 뿐만 아니라 새로운 플랫폼을 도입하여 5가지 Single-cell 플랫폼을 통해 다양한 연구 조건에 맞는 분석 옵션을 제공합니다.

다수의 샘플과 대규모 세포 분석을 위한 High-throughput Single-cell RNA-seq

Parse Biosciences의 Evercode WT v4는 Split-pool Combinatorial Barcoding 기술을 기반으로 세포별 고유한 바코드 조합을 형성하여 개별 세포의 유전자 발현을 분석하는 플랫폼입니다.

Parse Evercode 원리: 세포를 나누고 모으는 과정을 반복해 바코드 조합을 부여한 뒤 시퀀싱으로 개별 세포를 구분하는 과정
Adapted from Parse Biosciences

주요 특징

  • Split-pool Combinatorial Barcoding 기반 scRNA-seq 분석
  • Fixation으로 샘플 채취 시점의 유전자 발현 상태를 보존하고, 최대 6개월까지 보관 가능
  • 세포 10K개에서 최대 5M개, 샘플 1개부터 384개까지 유연하게 Multiplexing 가능
  • Trailmaker 분석 소프트웨어로 쉽고 간편하게 scRNA-seq Data Analysis 수행

다양한 크기의 세포 분석을 위한 Single-cell RNA-seq

Illumina의 PIP-seq은 Particle-templated Instant Partitions (PIPs) 기술을 기반으로 바코드가 결합된 Particle을 이용해 개별 세포를 Droplet으로 분리하고, 세포별 유전자 발현을 분석하는 플랫폼입니다.

Illumina PIP-seq 원리: 샘플 준비 후 보텍싱으로 세포와 바코드 입자를 에멀전에 포획하는 과정
Adapted from Illumina

주요 특징

  • Particle-templated Emulsification 기반의 세포 분리 및 바코딩
  • 비교적 큰 세포를 포함한 다양한 크기의 세포 분석에 적용 가능
  • 소규모 연구부터 대규모 분석까지 연구 규모에 따른 다양한 분석 옵션 제공 (2K / 10K / 20K / 100K cells)
  • 세포 확보가 어려운 샘플은 타 플랫폼 대비 효율적인 비용으로 scRNA-seq 수행

싱글셀 RNA-seq 분석 플랫폼 5종 비교

로킷제노믹스는 5가지 Single-cell 플랫폼을 통해 다양한 분석 옵션을 제공합니다.

PlatformKey Features
10x Genomics • Gene Expression, Immune Profiling, ATAC-seq 등 다양한 Single-cell Multiomics 분석 지원
• 다양한 연구 분야에서 축적된 활용 사례와 높은 기술적 신뢰도
BD Rhapsody • Sample Multiplexing을 통한 분석 비용 절감
• Granulocyte 분석 및 다양한 항체 패널 기반 RNA–Protein 동시 분석 지원
MobiDrop • 비용 부담을 낮춘 Droplet 기반 분석으로 Pilot Study에 적합
• ChIP-seq, Single Microbe-seq, Plant Single-cell RNA-seq 등 다양한 Application 지원
Parse Evercode (NEW) • 다수의 샘플을 활용한 대규모 Single-cell 분석에 적합
• Sample Fixation을 통한 유연한 샘플 수집 및 실험 일정 관리
Illumina PIP-seq (NEW) • 비교적 큰 세포를 포함한 다양한 크기의 세포 분석에 적합
• 연구 규모에 따라 다양한 Target Cell 수 선택 가능

다양해진 Single-cell 분석 서비스, 문의는 더 간편하게!

로킷제노믹스는 연구 목적과 샘플 특성, 분석 규모 및 예산을 고려하여 적합한 분석 방법을 제안하고, 샘플 준비부터 데이터 분석까지 전 과정을 지원합니다.

→ 로킷제노믹스 scRNA-seq 분석 서비스 자세히 보기

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